Pada tahun yang sama juga, ia mulai bekerja sebagai instruktur pelatih untuk federasi sepak bola Jepang (JFA). Pada periode 2006-2007, ia melatih tim usia muda Urawa Reds.
Selanjutnya, pada periode 2007-2008, Mochizuki menjadi pelatih kepala di JFA National Training Center. Pada tahun 2008, ia menjadi pelatih untuk tim kampus Biwako Seikei Sports University.
Tidak lama setelah itu, JFA memilih Mochizuki untuk melatih timnas wanita Jepang. Ia menjabat hingga tahun 2012 dan mencapai sejumlah prestasi selama masa jabatannya. Pada periode 2014-2017, Mochizuki melatih tim nasional universitas putri Jepang. Pada tahun 2019, ia kembali mendapat posisi tersebut setelah sempat menganggur. (cnn/hm20)
